Специальности:

* "Иностранный язык"
* "Национальная экономика"
* "Математика"
* "Русский язык и литература"
* "Социальная работа"
* "Педагогика и методика начального образования"
* "Биология"
* "Безопасность жизнедеятельности"
* "Педагогика и психология"
* "Педагогика и методика дошкольного образования"
* "Физика"
* "Дошкольная педагогика и психология"
* "Национальная экономика"
* "Психология"
* "Филология"
* "Информатика"
* "История"
* "Социальная педагогика"
* "Физическая культура"
* "Прикладная информатика (по областям)"

Приказом Министерства общего и профессионального образования Российской Федерации от 17 апреля 1998 года Балашовский государственный педагогический институт был реорганизован в Балашовский филиал Саратовского государственного университета имени Н. Г. Чернышевского.

В связи с этим ряд шагов в реорганизации филиала был направлен на объединение его внутренних структур. В вузе осталось 6 факультетов: физико-математический, филологический, педагогический (были объединены факультет педагогики и методики начального образования и факультет дошкольной педагогики и психологии), экономической, факультет психологии и социальной работы и факультет экологии и биологии. Вместо 22 кафедр в вузе осталось 19. Кафедра русского языка и методики его преподавания была присоединена к кафедре русского языка, объединены кафедра психологии и кафедра практической психологии в единую кафедру психологии, кафедра биологии и кафедра экологии — в кафедру биологии и экологии.

В 1998 году в филиале создаётся аспирантура, заведующей которой была назначена кандидат педагогических наук, доцент Алла Валерьевна Шатилова. В настоящее время в аспирантуре лицензировано 5 специальностей: теория и методика профессионального образования, педагогическая психология, экология, литература народов стран зарубежья (с указанием конкретной литературы) и теоретические основы информатики.

В 1999 году на базе отделения иностранных языков при филологическом факультете был создан факультет иностранных языков. При этом кафедра иностранных языков была разделена на две самостоятельные: кафедру английского языка и кафедру немецкого языка. В 2000—2001 учебном году в качестве второго иностранного языка был введён французский язык.

4 июля 2001 года в результате реорганизации факультета психологии и социальной работы были созданы два самостоятельных факультета: психологии и валеологии (с 2002 года — психологии) и социальной работы. В составе факультета психологии были образованы две кафедры: практической психологии и психологии.

В 2002 году в результате реорганизации факультета психологии и валеологии был создан факультет физической культуры и безопасности жизнедеятельности, в составе трёх кафедр: медико-валеологических дисциплин (до этого кафедра валеологии и специальной психологии), кафедры безопасности жизнедеятельности и кафедры физкультуры, которая с 2003 года получила статус выпускающей кафедры.

С 18 декабря 2003 года в БФ СГУ издаётся газета «Хопёрские семестры».

В сентябре 2008 года реорганизован в Балашовский институт Саратовского государственного университета имени Н. Г. Чернышевского.