Наш Лицей начинает свою историю с 1912 года, когда на средства купеческой вдовы Ксении Никитичны и ее сына Владимира Васильевича Агафоновых открыли в Агафоновском поселке церковно-приходскую школу.

В 1925 году школа переезжает в новое здание – теперь это - малая школа.

Основное здание нынешнего лицея было построено в 1935 году.

До 1953 года в нем размещались две школы - мужская и женская. В 1953 году школа была реорганизована в среднюю политехническую общеобразовательную школу № 2 ПЖД. В 1961 году переименована в среднюю общеобразовательную школу № 96.

Итогом многосторонней инновационной деятельности Лебедевой К. А. являлось высокое качество знаний учащихся, позволившее экспертной комиссии Управления образования Саратовской области присвоить школе статус школы-лицея в 1992 году, а в 1998 получить статус лицея.

За успехи, достигнутые лицеем и за большую общественную работу Лебедева К.А. неоднократно была награждена Почетными грамотами ЦК КПСС и Совета Министров СССР ВЦСПС, Министерства просвещения, награждена значками "Отличник народного просвещения РСФСР", "Отличник народного просвещения СССР", медалью "Ветеран труда". В 1991 году присвоено звание "Заслуженный учитель школы РФ".

В 2003 году наш Лицей возглавила Акимова Людмила Владимировна.

Благодаря Акимовой Людмиле Владимировне в Лицее значительно укрепилась учебно-материальная база. За последние три года лицеем приобретена новая школьная мебель для классных комнат, созданы два современных компьютерных класса, обновлена система электроосвещения здания лицея, создана система противопожарной безопасности, оборудованы 2 медицинских и 1 стоматологический кабинет, приобретены новые технические средства обучения. В 2004/2005 году была осуществлена замена труб холодного водоснабжения лицея, капитально отремонтированы с установкой пластиковых рам 16 учебных кабинетов, столовая, укомплектованы медицинский и стоматологический кабинеты новым современным медицинским оборудованием, произведен капитальный ремонт и комплектование новой мебелью актового зала.

К началу 2006/2007 учебного года был произведен монтаж 94 новых оконных блоков. Полностью отремонтированы 13 классов. В них поменяли мебель, заменили электропроводку.

За успехи достигнутые лицеем и за большую общественную работу Акимова Л.В. неоднократно была награждена Почетными грамотами отдела образования Октябрьского района, награждена значком" Почетный работник общего образования РФ". В 2006 году ее фамилия занесена на Городскую Доску Почета.