По словам заместителя директора по учебной работе Лицея прикладных наук Елены Андреевой, в этом учебном заведении действует синергетическая концепция в образовании и воспитании. А самая большая уникальность Лицея в том, что после четырех лет обучения в нем специализированное образование продолжается на факультете нелинейных процессов СГУ.