CH2OH
CHOH --------------------------------------→
CH2OPO3H2 R1-CO-SKoA 2 SH-KoA
R2-CO-SKoA

Фосфатидная кислота является важным промежуточным продуктом обмена фосфоглицеридов. Фосфатидная кислота является сигнальной молекулой. Она является короткоживущим сигналом, который гидролизуется далее до диглицерида под действием фосфогидролазы.

Как правило, фосфатидная кислота, образующаяся под действием фосфолипазы D, содержит мононенасыщенные и/или насыщенные жирные кислоты. Это отличает соответствующие сигнальные пути от таковых с участием диглицерида, который, как правило, содержит полиненасыщенные жирные кислоты. Фосфатидная кислота может быть превращена с помощью фосфогидролазы в диацилглицерол, являющийся активатором протеинкиназы С.